Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P06344 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P06344 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P06344 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P06344 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P06344 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms