Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
H2-Eb1P04230 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
H2-Eb1P04230 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms