Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01641 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01641 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01641 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01641 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01641 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01641 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01641 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01641 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01641 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01641 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01641 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01641 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01641 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01641 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01641 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
P01641 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01641 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01641 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01641 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01641 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01641 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01641 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01641 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01641 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01641 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01641 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01641 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01641 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
P01641 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01641 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01641 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01641 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01641 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01641 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01641 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01641 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01641 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01641 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01641 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01641 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01641 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01641 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01641 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01641 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01641 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
P01641 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01641 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01641 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01641 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01641 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P01641 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms