Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops3O88543 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops3O88543 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cops3O88543 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms