Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vti1bO88384 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vti1bO88384 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.5 ms