Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnnt1O88346 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnnt1O88346 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms