Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtssO70370 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtssO70370 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CtssO70370 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CtssO70370 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtssO70370 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtssO70370 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtssO70370 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtssO70370 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtssO70370 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtssO70370 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtssO70370 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtssO70370 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtssO70370 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtssO70370 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtssO70370 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtssO70370 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtssO70370 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CtssO70370 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtssO70370 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtssO70370 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtssO70370 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtssO70370 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms