Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Itgb5O70309 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Itgb5O70309 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms