Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cyp26a1O55127 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cyp26a1O55127 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms