Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pole2O54956 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pole2O54956 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms