Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srpk2O54781 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms