Protein–RNA interactions for Protein: O35972

Mrpl23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl23O35972 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl23O35972 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl23O35972 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms