Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CaluO35887 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CaluO35887 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CaluO35887 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CaluO35887 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CaluO35887 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CaluO35887 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CaluO35887 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CaluO35887 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CaluO35887 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CaluO35887 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CaluO35887 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CaluO35887 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CaluO35887 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CaluO35887 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CaluO35887 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CaluO35887 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CaluO35887 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CaluO35887 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CaluO35887 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms