Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Xbp1O35426 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms