Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Abcc1O35379 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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Abcc1O35379 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
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Abcc1O35379 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abcc1O35379 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Abcc1O35379 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
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Abcc1O35379 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Abcc1O35379 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abcc1O35379 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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Abcc1O35379 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abcc1O35379 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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Abcc1O35379 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abcc1O35379 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abcc1O35379 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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Abcc1O35379 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abcc1O35379 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abcc1O35379 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abcc1O35379 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abcc1O35379 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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Abcc1O35379 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abcc1O35379 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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Abcc1O35379 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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Abcc1O35379 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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Abcc1O35379 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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Abcc1O35379 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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