Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Capn1O35350 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms