Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ArxO35085 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ArxO35085 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ArxO35085 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ArxO35085 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ArxO35085 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ArxO35085 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ArxO35085 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ArxO35085 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms