Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Flot1O08917 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Flot1O08917 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Flot1O08917 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Flot1O08917 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Flot1O08917 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Flot1O08917 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flot1O08917 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Flot1O08917 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Flot1O08917 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Flot1O08917 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Flot1O08917 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Flot1O08917 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Flot1O08917 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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