Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms