Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm8888J3QPX5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm8888J3QPX5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms