Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim18J3QNP2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Smim18J3QNP2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim18J3QNP2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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