Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC32.07■■■□□ 2.73
Ccdc180J3QNE4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ccdc180J3QNE4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc180J3QNE4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms