Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem200cJ3QK46 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms