Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubgcp6G5E8P0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubgcp6G5E8P0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms