Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vmn1r67G5E8C1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r67G5E8C1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms