Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r58G3X9U3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms