Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf148G3X9R7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf148G3X9R7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms