Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arfgef1G3X9K3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfgef1G3X9K3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms