Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ScaperF8VQ70 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms