Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ercc6F8VPZ5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms