Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm28048F7BCN0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm28048F7BCN0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Gm28048F7BCN0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Gm28048F7BCN0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Gm28048F7BCN0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm28048F7BCN0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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