Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
D430041D05RikF6ZGR6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
D430041D05RikF6ZGR6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms