Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Herc6F2Z461 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Herc6F2Z461 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Herc6F2Z461 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Herc6F2Z461 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Herc6F2Z461 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Herc6F2Z461 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Herc6F2Z461 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Herc6F2Z461 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Herc6F2Z461 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Herc6F2Z461 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms