Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610001J05RikF2Z3Y9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms