Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
4930451I11RikE9Q9R3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms