Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A430078G23RikE9Q7Y4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A430078G23RikE9Q7Y4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A430078G23RikE9Q7Y4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A430078G23RikE9Q7Y4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A430078G23RikE9Q7Y4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms