Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc85cE9Q6B2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms