Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17175E9Q528 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17175E9Q528 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms