Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pde8bE9Q4S1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pde8bE9Q4S1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pde8bE9Q4S1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pde8bE9Q4S1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde8bE9Q4S1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde8bE9Q4S1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde8bE9Q4S1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde8bE9Q4S1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde8bE9Q4S1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pde8bE9Q4S1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms