Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn1r238E9Q373 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r238E9Q373 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms