Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Y9

Krt83, Keratin 83, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt83E9Q1Y9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krt83E9Q1Y9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt83E9Q1Y9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms