Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NebE9Q1W3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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