Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Zfp558E9Q1J0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Zfp558E9Q1J0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Zfp558E9Q1J0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Zfp558E9Q1J0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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