Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vmn1r68E9Q0V3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms