Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms