Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930426L09RikE9Q0N7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930426L09RikE9Q0N7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms