Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fndc1E9Q043 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms