Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms