Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms