Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syde2E9PUP1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.4 ms